En casi 25 años, la Justicia argentina no logró juzgar a los acusados de ser los autores materiales e intelectuales del peor atentado que sufrió la Argentina. Rafecas, con su resolución, blindó la figura del juicio en ausencia ante la oposición del defensor oficial y otros. Citó otros juicios similares para casos de terrorismo y genocidio en El Líbano, la ex Yugoslavia, Italia y Ruanda.

El juez accedió al planteo de la UFI AMIA para juzgar en ausencia a los libaneses e iraníes prófugos y con pedidos de captura. La iniciativa, impulsada por el Gobierno, había desatado una polémica por rozar las garantías del debido proceso y violar el derecho a defensa.